2014年01月 — 2017年12月: 微生物组学数据集成及分析的关键技术研发（经费170万人民币）。国家高技术研究发展计划（863计划）子课题。子课题负责人。
2013年01月 — 2016年12月: 基于海量样本的高性能元基因组数据分析策略和方法开发（经费80万人民币）。中国国家自然科学基金面上项目（项目编号：31271410）。项目负责人。
