Scientific Research
Bioinformatics，Microbiome，AI Biology，Omics Big-data，High Performance Computation
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[1] Pengshuo Yang, Wei Zheng, Kang Ning*, Yang Zhang*. Decoding the link of microbiome niches with homologous sequences enables accurately targeted protein structure prediction. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), 2021, 118 (49): e2110828118. doi: 10.1073/pnas.2110828118. (SCI impact factor 12.779)
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[2] Mo Zhu1, Kai Kang1, Kang Ning*. Meta-Prism: Ultra-fast and highly accurate microbial community structure search utilizing dual-indexing and parallel computation. Briefings in Bioinformatics, 2021, 22 (1): 557-567. doi: 10.1093/bib/bbaa009. (SCI impact factor 13.994)
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[3] Yan Zhao1,Mingyue Cheng1, Liang Zou, Luxu Yin, Xue Zhu, Yuguo Zha , Lei Zhang*, Kang Ning*, Jinxiang Han*. Hidden link in gut-joint axis: gut microbes promote rheumatoid arthritis at early stage by enhancing ascorbate degradation. Gut , 2022, 71 (5): 1041-1043. doi: 10.1136/gutjnl-2021-325209.
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[4] Yuguo Zha, Kang Ning*. Ontology-aware Neural Network: A general framework for pattern mining from microbiome data. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23 (2): bbac005. doi: 10.1093/bib/bbac005. (SCI impact factor 13.994)
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[5] Lei Ji1, Lu Zhang1, Zhi Wang*, Xue Zhu, Kang Ning*. High biodiversity and distinct assembly patterns of microbial communities in groundwater compared with surface water. Science of the Total Environment, 2022, 834: 155345. doi: 10.1016/j.scitotenv.2022.155345.
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[1] 2021年01月 — 2024年12月: 基于微生物组大数据和深度学习技术的蛋白质结构和功能挖掘（经费58万人民币）。中国国家自然科学基金面上项目。项目负责人。
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[2] 2019年01月 — 2022年12月: 肠道微生物群落可塑性的大数据建模和深度理解（经费60万人民币）。中国国家自然科学基金面上项目。项目负责人。
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[3] 2018年07月 — 2020年12月: 高通量组学数据分析工具与方法研究（经费179万人民币）。国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项课题。课题负责人。
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[4] 2017年01月 — 2020年12月: 微生物大数据整合与数据挖掘方法研究（经费60万人民币）。中国国家自然科学基金面上项目。项目负责人。
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[5] 2016年01月 — 2020年12月: 生物信息学。湖北省楚天学者特聘教授计划。项目负责人。